L'ancien cimetière était situé à l'ouest de l'édicule portant la statue de Saint Joseph, là où se trouvait la chapelle Notre-Dame. Une carte marine représentant l'archipel de Molène vers 1771 permet de voir de façon distincte deux enclos ou placîtres avec édifices religieux. S'il devait y avoir un cimetière près de l'ancienne église celui ci devait être le faible importance d'où un second plus à l'ouest.

Le cimetière actuel a la particularité d'accueillir les tombes des victimes du naufrage du Drummond Castle.