Le manoir de Pont-Couënnec est édifié en moellons de granite sur un plan d'ensemble en L. Il comprend un corps de logis primitif au nord-est (vers 1500), un corps de logis dans l'angle (vers 1600) et un corps de logis rapporté au sud-est (2ème moitié 19ème siècle) flanqué d'un logement plus bas (1er quart 20ème siècle). Le corps de logis primitif est composé d'un rez-de-chaussée et d'un étage carré prenant jour au sud-est par l'intermédiaire d'une fenêtre à traverse couverte d'un linteau à double accolade (ancienne croisée). Le mur-pignon droit, sur lequel est accolé un bâtiment couvert d'un toit en appentis, est pourvu de rampants à crossettes figurées. Le corps de logis dans l'angle est orné d'une corniche à modillons et présente un toit en pavillon. Il est composé d'un rez-de-chaussée et de deux étages carrés. Les murs nord et est portent chacun une souche de cheminée élancée construite en moyen appareil de granite. Une tour demi-hors-oeuvre sur l'angle coiffée d'un toit polygonal abrite un escalier en vis en maçonnerie à l'ouest. Elle est ouverte au rez-de-chaussée d'une porte en plein-cintre jouxtant à gauche une autre porte en plein-cintre desservant la pièce du rez-de-chaussée (indication d'un prolongement du corps de logis dans cette direction). Le deuxième étage prend jour au sud-ouest par une fenêtre surmontée d'un fronton-pignon de style Renaissance. Le corps de logis rapporté au sud-est est divisé par un mur de refend portant souche de cheminée. Il prend jour à l'avant et à l'arrière. Le colombier, situé au nord, est édifié en grand appareil de granite rose. De plan circulaire, il est couvert d'une coupole en pierre à jour central. La porte d'entrée placée au sud est feuillurée. A l'intérieur, l'appareil présente une alternance de lits de schiste et de blocs de granite séparés les uns des autres par des boulins disposés en quinconce.