Le moulin du Dourduff-en-Terre se situe à l'embouchure du ruisseau du Dourduff, se jettant lui même dans la rade de Morlaix. Le bâtiment flanque une courte digue rectiligne en aval. Cette dernière est constituée d'un appareil de moellons et percée par un coursier double, une vanne de trop plein et une vanne correspondant à la porte mer.

Le moulin du Dourduff-en-Terre fait partie des moulins intermédiaires, c'est-à-dire qu'il fonctionne alternativement avec la marée et l'eau de la rivière. Si l'utilisation de l'eau du ruisseau ne fait pas de doute, celle de la marée n'est pas aussi évidente. En effet l'élément qui permet de distinguer les moulins à marée est une porte mer automatique, c'est-à-dire une porte qui laisse passer le flux de la mer à marée montante et se bloque à marée descendante. Or le moulin du Dourduff-en-Terre, qui semble avoir utilisé l'eau de mer de manière régulière, est pourtant doté d'une porte à mer qui s'actionnait manuellement alors que le système automatisé existait déjà.

Le moulin du Dourduff-en-Terre présente la particularité de combiner une roue horizontale, aussi appelée pirouette et une roue verticale extérieure, association rare dans les moulins à marée. Un coursier sépare en deux l'arrivée d'eau de la retenue. Les meules étaient faites en grès local et il est aujourd'hui encore possible de voir leur coffrage. Le treuil qui permettait de lever les meules, aussi appelé cage à écureuils est intégré aux éléments de charpente, il est également encore présent.

Le bâtiment s'organise selon un plan rectangulaire et est doté d'une fosse qui accueille les mécanismes de meuneries. Ses murs sont réalisés en moellons de pierres locales. Les angles et hauts des pignons se terminent quant à eux par des pierres de tailles. Le soubassement est également réalisé en pierres de taille car davantage exposé à l'eau et donc sujet aux dégradations. La façade amont accueille la porte d'entrée remarquable par ses encadrements faits de grosses pierres non taillées pour certaines. Certains éléments sont au contraire sculptés. Sont également présentes deux fenêtres qui ont été comblées en partie basse comme l'indiquent d'anciens clichés. Cette façade accueille aussi deux « pierres à cheval » , petits appendices muraux destiné à attacher les chevaux.

La façade aval présente deux épaulements qui préviennent l'enfoncement dans la vase ainsi qu'un fenestron et une ouverture pour permettre l'écoulement de l'eau ayant actionné la pirouette.

La partie haute des façades nord et sud présente encore des traces d'enduit, traitement assez rare pour les moulins à marée, et la façade Nord, qui correspond à la roue extérieure présente un fenestron.

La couverture du moulin en ardoise présente un coyau et a été refaite il y a une quinzaine d'années . La toiture vient buter contre un pignon qui est légèrement plus haut, ce qui a pour effet de la protéger du vent. En bas de la pente du toit, la jonction des pierres de taille qui terminent le pignon avec le sommet du chaînage d'angle donne lieu à la présence d'une « crossette », ou corbeaux arrondis que l'on retrouve aux quatre coins du bâtiment. Les dépendances du moulin, notamment les crèches à cochon et à vaches étaient encore jusqu'en 1779 surmontées d'une couverture de genêt.