Située à la frange ouest du Pays de Fougères, Coglais Communauté offre un paysage homogène, alternant boisements et haies bocagères, sillonné ici et là par de nombreux vallons façonnés par les multiples ruisseaux et rivières qui le parcourent. C'est bien l'impression de verdure qui domine dans ce territoire encore fondamentalement rural.

Le sous-sol granitique a donné la matière première aux constructeurs et il apparaît en de nombreux affleurements sur le territoire. La toponymie garde aussi les traces de l'importance de la pierre, on ne compte plus les écarts nommés Rocher ou Roche. La topographie, marquée par une succession de vallons et de buttes, fait varier l'altitude d'une cinquantaine de mètres dans le sud-ouest, dans la vallée de la Minette, à plus de 190 mètres sur les hauteurs de Saint-Germain-en-Coglès et du Châtellier.

Les trois principales rivières, le Tronçon, la Minette et la Loisance, sont des affluents du Couesnon. Le Tronçon marque la limite nord du territoire et de la commune de Coglès. La seconde, prenant sa source à Saint-Germain-en-Coglès, traverse le sud du territoire en passant par Saint-Hilaire-des-Landes, Baillé et Le Tiercent, servant même de délimitation entre ces communes. La Loisance naît quant à elle au Châtellier, puis traverse Saint-Germain-en-Coglès, Saint-Etienne-en-Coglès et Saint-Brice-en-Coglès. Le réseau hydrographique est complété par d'innombrables ruisseaux qui affirment l'importance de la ressource en eau du territoire. Cette ressource est d'ailleurs exploitée puisqu'un aqueduc souterrain traverse le territoire depuis Saint-Germain-en-Coglès, permettant ainsi d'alimenter la ville de Rennes. Ce dernier, construit en 1882 mais régulièrement remanié depuis, serpente sur les 42 kilomètres qui séparent sa source de son point de distribution rennais.

La végétation est dominée par le réseau bocager, malgré quelques boisements importants à Coglès et sur les reliefs de Saint-Germain-en-Coglès ou du Châtellier. La densité relativement importante de ces haies en certains points du territoire accentue l'impression d'un paysage boisé. Seule la partie sud de la communauté de communes offre des paysages plus ouverts, issus des travaux de remembrement.