La chapelle a été bâtie en 1672, comme le montre l’inscription située au-dessus de la porte sud : H LE GAL FABRIQUE 1672 MI J PERENNES REC(teur) D(e) PRIMELEN DOIEN DE CAPZISN. La même date se retrouve sur une poutre intérieure qui porte l'inscription : IAN MAUBRAS 1672.
Elle a été restaurée à la fin du 19e siècle par monseigneur Théodore Lamarche, évêque de Quimper et Léon et est aujourd’hui en très bon état.
Sur le cadastre de 1837, on observe que la chapelle est accompagnée d’une croix monumentale et d’un moulin à vent isolé. Seule la croix est encore sur place. Le moulin, visible sur les photos aériennes de 1950, a aujourd’hui disparu.
Dans la nouvelle édition revue et augmentée en 1843 du dictionnaire historique et géographique de Jean Ogée, les auteurs signalent un « singulier monument » à proximité de la chapelle : une "sorte d’auge" enterrée et surmontée d’une dalle de granite. Appelé à l’époque « autel de St Théodore », ce monument, qui est en fait une tombe en coffre de l'âge du bronze, est toujours présent sur le site.
Chargée d'études à l'Inventaire