A l´époque médiévale, une pêcherie est mentionnée à Morgat, immédiatement à l´ouest de la localité. Elle est formée « d´une jetée à pierres perdues » ouverte en son milieu et permettant la mise en place d´un filet. Au 18e siècle, elle sert de port pour les chaloupes sardinières locales. Mais cet ouvrage fragile est régulièrement disloqué par la houle et les pêcheurs réclament de nouveaux aménagements. La construction du môle en pierre actuel débute en 1845. Cependant, l´entrepreneur Bouilly de Douarnenez qui se charge des travaux perd rapidement de l´argent si bien que le chantier interrompu ne reprend qu´en 1857 par voie de régie sous la direction des Ponts et Chaussées. Les tâcherons employés utilisent le matériel laissé par le sieur Bouilly (planches, pierres). L´ouvrage livré en 1861 aura coûté 95 000 francs. En 1903, il est allongé pour protéger le port de la houle du large et assurer un abri aux navires en escale, aux barques de pêche locales et au vapeur de Brest. La Chambre de Commerce et d´Industrie de Brest se charge de ces travaux ainsi que de l´élargissement plus tardif du môle (1951). Entre les deux guerres, le môle est aussi utilisé par les touristes de la station balnéaire qui y amarrent leurs voiliers de plaisance au milieu des bateaux de pêche de la localité. Depuis le 1er janvier 2003, la propriété et la gestion du port sont passées de l´Etat à la commune de Crozon. Aujourd´hui, le môle sert à l´embarquement pour les visites des grottes de Morgat et pour la plaisance.