Selon Banéat, Villa Nova est donnée à l´abbaye Saint-Georges, en 1040. L´ancien manoir, qu'une description donnée par l´auteur date du 16e siècle, possédait un colombier, connu par une photographie du début du siècle. Son jardin était entouré d´une douve, visible sur le cadastre de 1842, qui figure également un vivier. La construction d´une maison de plaisance, à la fin du 18e siècle, peut être attribuée aux de Trogoff, qui possèdent le domaine entre 1771 et 1827. Elle deviendra la propriété de l´entrepreneur J. Vaudois, à l´origine du développement du quartier, en 1872. En 1920, la ville rachète à la Société Bretonne de Crédits et de Dépôts de Brest les vestiges de l´ancien manoir et de ses jardins. Dès 1923, le conseil municipal décide d´y établir une école de filles. L´architecte de la ville, Emmanuel Le Ray, est chargé de la restauration du logis, dans lequel on aménage quatre salles de classes élémentaires, un logement pour la directrice, à l´est, un parloir, un cellier et une chambre, à l´ouest. Une salle de classe enfantine est aménagée dans un bâtiment annexe. En 1927, la municipalité vote la création de 2 classes supplémentaires. En 1931, elle envisage la construction d'un nouveau bâtiment, rue Ginguené, abritant 8 salles de classe. Les travaux sont réalisés entre 1931 et 1939, sur les plans d´Emmanuel Le Ray et de son successeur, Yves Le Moine. Pendant la Seconde Guerre mondiale, l´école est occupée par les troupes allemandes et touchée par les bombardements de 1943. Entre 1948 et 1958, l´édifice est agrandi d´une cantine (1948-1950), d´un nouveau logement pour la directrice (1956-1957), enfin de nouvelles salles de classe (1958), construites au sud après la destruction de l'ancien logis du manoir, sur les plans de l´architecte communal Yves Le Moine.